Garantizar la exactitud de los saldos de las cuentas que conforman los Estados Financieros de la Institución y suministrar de manera eficiente y confiable la información resultante de los registros contables.
Sección de Registros Contables
Registrar la información financiera de funcionamiento e inversión para proporcionar a los usuarios del sistema de contabilidad una base de datos contables común, uniformemente, oportuna y confiable para fines de análisis, control y toma de decisiones gerenciales.
Sección Contable de Autogestión (Servicios Especiales).
Registrar la información financiera de autogestión del Campus Central y Harmodio Arias Madrid para proporcionar a los usuarios del sistema de contabilidad una base de datos confiable común, uniforme, oportuna y confiable para fines de análisis, control y toma de decisiones gerenciales.
Sección de Cuentas por Pagar
Garantizar el cumplimiento oportuno de los pagos en moneda de curso legal, en efectivo, cheque y/o mediante transferencias bancarias, con base a la programación existente.
Sección de Análisis de informes financieros y control contable
Elaborar estudios de carácter económico-financiero  de los Estados Financieros con la finalidad de elaborar propuestas, información que contribuya a la toma de decisiones económicas y financieras.
Evaluar continuamente las actividades y operaciones financieras con la finalidad de identificar áreas de riesgo que puedan afectar el cumplimiento de sus objetivos y metas de tal forma que la evaluación de riesgo sea un mecanismo para fortalecer, adecuar, ajustar y renovar los controles internos establecidos, de manera que los mismos sean cada vez más  eficientes  y  efectivos,  para  brindar  resultados  financieros  confiables.
Sección de Bienes Patrimoniales
Garantizar el registro y control oportuno y eficiente de los bienes muebles e inmuebles pertenecientes a la Universidad, y realizar el inventario anual de bienes muebles e inmuebles para los registros contables y fiscales.